Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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