Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AtrxQ61687 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms