Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dsg1aQ61495 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1aQ61495 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.8 ms