Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1eQ61290 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1eQ61290 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1eQ61290 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1eQ61290 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1eQ61290 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1eQ61290 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1eQ61290 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1eQ61290 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1eQ61290 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms