Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OclnQ61146 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OclnQ61146 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OclnQ61146 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
OclnQ61146 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OclnQ61146 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OclnQ61146 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OclnQ61146 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OclnQ61146 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OclnQ61146 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OclnQ61146 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OclnQ61146 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms