Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sim1Q61045 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sim1Q61045 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sim1Q61045 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sim1Q61045 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sim1Q61045 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sim1Q61045 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms