Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms