Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ncor1Q60974 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ncor1Q60974 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ncor1Q60974 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncor1Q60974 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ncor1Q60974 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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