Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin1Q60865 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Caprin1Q60865 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms