Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr2f1Q60632 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2f1Q60632 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms