Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc1Q60596 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms