Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sin3aQ60520 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms