Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arcn1Q5XJY5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arcn1Q5XJY5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arcn1Q5XJY5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arcn1Q5XJY5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arcn1Q5XJY5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arcn1Q5XJY5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arcn1Q5XJY5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arcn1Q5XJY5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arcn1Q5XJY5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arcn1Q5XJY5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arcn1Q5XJY5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms