Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY4

Parl, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParlQ5XJY4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ParlQ5XJY4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ParlQ5XJY4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ParlQ5XJY4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ParlQ5XJY4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ParlQ5XJY4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ParlQ5XJY4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ParlQ5XJY4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ParlQ5XJY4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ParlQ5XJY4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms