Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc125Q5U465 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms