Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Specc1Q5SXY1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms