Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWZ9

Pld6, Mitochondrial cardiolipin hydrolase, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld6Q5SWZ9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Pld6Q5SWZ9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Pld6Q5SWZ9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pld6Q5SWZ9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pld6Q5SWZ9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pld6Q5SWZ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pld6Q5SWZ9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pld6Q5SWZ9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pld6Q5SWZ9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pld6Q5SWZ9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pld6Q5SWZ9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pld6Q5SWZ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pld6Q5SWZ9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pld6Q5SWZ9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pld6Q5SWZ9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pld6Q5SWZ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms