Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd40Q5SUE8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd40Q5SUE8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms