Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RilpQ5ND29 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms