Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim41Q5NCC3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim41Q5NCC3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms