Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms