Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf3Q5HZG4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms