Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3kQ5GIG6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3kQ5GIG6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms