Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrc3Q5DU56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms