Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chsy3Q5DTK1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chsy3Q5DTK1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms