Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Znf354cQ571J5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf354cQ571J5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms