Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpjQ569L8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpjQ569L8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms