Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig2Q52KR2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms