Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spire1Q52KF3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spire1Q52KF3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms