Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx33Q4VAA7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Snx33Q4VAA7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx33Q4VAA7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx33Q4VAA7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx33Q4VAA7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx33Q4VAA7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx33Q4VAA7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx33Q4VAA7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx33Q4VAA7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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