Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdv3Q4VAA2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms