Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Xirp2Q4U4S6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Xirp2Q4U4S6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms