Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc3lQ4KL14 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc3lQ4KL14 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms