Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Fam220aQ3ZN08 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Fam220aQ3ZN08 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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