Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms