Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Lrrc43Q3V0L5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Lrrc43Q3V0L5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc43Q3V0L5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc43Q3V0L5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms