Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fbQ3UWQ3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2fbQ3UWQ3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms