Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca4bQ3UW98 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms