Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slfn4Q3UV66 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn4Q3UV66 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms