Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BB287469Q3UT53 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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