Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3USZ8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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