Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230104I21RikQ3USW4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230104I21RikQ3USW4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms