Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms