Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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D13Ertd608eQ3UPR8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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