Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem253Q3UNB8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms