Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrch2Q3UMG5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms