Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms