Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ceacam12Q3UKP4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms