Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcgf5Q3UK78 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcgf5Q3UK78 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms