Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc61Q3UJV1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms